他缓慢而有力的在车里撞着视频数学科学学院

优秀学术成果巡礼第六期

近期，国际知名学术期刊“Bioinformatics”（生物信息学）发表了他缓慢而有力的在车里撞着视频数学科学学院统计学系周彦副教授与其硕士生张颖、彭敏娇、温州医科大学苏建忠教授与其研究生张雅茹、李成浩、舒连杰、他缓慢而有力的在车里撞着视频胡耀华教授、香港城市大学徐锦峰副教授合作的学术论文“scDMV: a zero–one inflated beta mixture model for DNA methylation variability with scBS-seq data”。

单细胞DNA差异甲基化区域检测是生物信息学领域的热门研究问题之一，利用单细胞重亚硫酸氢盐测序技术(scBS-seq)可以在单个细胞水平上精确分析DNA甲基化模式，从而鉴定罕见群体，揭示细胞特异性表观遗传变化，并改进差异甲基化分析。然而，测序深度和覆盖范围有限，使得数据稀疏并且出现大量的0和1，导致使用scBS-seq数据进行差异甲基化检测的精度较低。因此，迫切需要一种能够有效应对数据稀疏且0-1膨胀的新的差异甲基化分析方法，提高差异甲基化区域识别精度。

针对上述挑战，本文提出了一种新方法，称为scDMV，用于分析单细胞重亚硫酸氢盐测序数据的甲基化差异，该方法能适应低输入序列并有效地处理过量的0和1。大量的模拟实验和实际数据分析表明，scDMV方法在灵敏度、精度和控制假阳性率方面显著优于现存的方法。此外，scDMV还揭示了单细胞全基因组测序数据中基因本体富集分析的重要信息，这些信息往往被其他方法所忽视。

全文链接：https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btad772